Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms