Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DMDP11532 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DMDP11532 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DMDP11532 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DMDP11532 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DMDP11532 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DMDP11532 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DMDP11532 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms