Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRIM38O00635 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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