Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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