Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FRMD3A2A2Y4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms