Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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