Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms