Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms