Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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