Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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