Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBB2BQ9BVA1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms