Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms