Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLF2Q8IX21 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLF2Q8IX21 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms