Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP43Q70EL4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms