Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTXN3Q4LDR2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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