Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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