Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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