Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CCDC142Q17RM4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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CCDC142Q17RM4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CCDC142Q17RM4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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