Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTN1Q16799 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms