Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms