Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTF1Q16619 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTF1Q16619 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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