Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms