Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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