Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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