Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms