Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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