Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALCAMQ13740 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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