Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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