Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC087894.2-201ENST00000541797 462 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 BEAN1-AS1-203ENST00000569125 530 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NARF-IT1-201ENST00000584012 769 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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