Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms