Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms