Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms