Protein–RNA interactions for Protein: P63146

UBE2B, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2BP63146 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2BP63146 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms