Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms