Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GSCP56915 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GSCP56915 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GSCP56915 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GSCP56915 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms