Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL23P55773 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL23P55773 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL23P55773 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms