Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC5A3P53794 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms