Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA2P51531 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms