Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNA2P51530 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNA2P51530 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms