Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms