Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC1A1P43005 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms