Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PPARGP37231 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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