Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ARL3P36405 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms