Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP1P29466 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP1P29466 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms