Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms