Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms