Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms