Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.5 ms