Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DESP17661 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DESP17661 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DESP17661 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms