Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms